外观区别，圣女果果实较长，颜色呈黄色和红色，千禧果果实短小，表皮呈深红色；口感，圣女果入口酸味较重，千禧果口感酸味较轻，甜味较重；产地区别，圣女果原产地在台湾，千禧果是由圣女果培育出的新品种，产地在广东和广西地区。

1、外观区别

圣女果和千禧果从外观上看就有着明显的区别。圣女果的果实较长，在市场上常见的颜色有红色和黄色两个品种。千禧果果实较为短小，果实较为圆润矮小，整体要比圣女果小一倍，果皮呈深红色。

2、口感不同

圣女果和千禧果在口感上也存在着区别，圣女果入口酸味较重，受欢迎的人群较少。千禧果口感更好，酸味较轻，甜味较重，并且内部的含水量较大，入口清甜爽口，更少欧人们的欢迎。

3、产地区别

圣女果和千禧果的产地也有区别，圣女果是由台湾引进的新品种，对环境的适应性较强，在我国大部分地区均能栽种，产量较高，上市期在7月至次年的2月。千禧圣女果是从圣女果中培育出的新品种，主要产地在海南，在广东和广西地区也有少量栽培，一般在年底上市。

4、品种不同

圣女果常被乘坐为小西红柿、樱桃西红柿、樱桃番茄、小柿子等，不属于转基因品种。千禧果的学名叫“千禧小番茄”营养价值较为丰富，果实中维生素含量较高，居于果蔬之首。